自汉建安六年(201年)至清康熙二十五年(1686年)的近1500年间，先后析出增城、东官(东莞)、怀化、熙安、南海、从化、花县等，并由这些县再析出龙门、香山(中山)、新安(宝安)、顺德、三水等县以及香港、澳门地区。在历史上番禺两度并入南海计有110年，三度成为南越、南汉、南明的小国之都，共148年。自1686年(清康熙二十五年)析地建花县后，至1921年广州建市的235年间境域基本没有变动。以当时县学宫(今广州农讲所)为中心，正北48里(华里)至花县界，正南35里至顺德县界，正东51.5里至增城县界，正西1.5里至南海县界，东北70.5里至从化县界，东南75里至东莞县界，西北2里及西南3.5里至南海县界。
1921年(民国10年)广州正式建市，捕属(广州市东半部)及河南街区划为市区。其后数年，近郊乡村相继划属广州。1949年建国后，分数次将禺北、禺东一带划入广州市区。1959年，原属中山县的大岗、万顷沙、南沙、黄阁、珠江农场划归番禺。
番禺县历史上的辖境，由于政区的调整而不断缩小；但现县境处于珠江出海口，不断扩展的滩涂，使可耕地日益增多，现县耕地80％是近1000多年来冲积而成的，建国后新围垦的耕地亦近10万亩。
朝代 | 年号 | 公元 | 置废移改及县治 | 隶属及县称 | 境域变动 | 备注 |
春秋 | | 前770~前477年 | | 百越之地
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战国 | | 前475~前221年 | | 楚国、扬越、陆梁、贲禺
| | 《山海经》作“贲禺”、“贲隅”
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秦 | 始皇三十三年 | 前214年 | 略取岭南，设桂林、象郡、南海三郡。南海郡治番禺
| 南海郡番禺县
| | 番禺建县自此始
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汉 | 高祖三年 | 前204年 | 南海尉赵佗自立为南越武王，后称南武帝，定都番禺
| 南越国番禺
| | 据出土文物，汉初书作“蕃禺”
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元鼎六年 | 前111年 | 汉军平南越。番禺城毁于火。复置南海郡，治番禺。
| 南海郡番禺县
| | 《读史方奥纪要》载：由于赵佗城夷为平地“汉筑番禺城于郡南六十里为南海治，今龙湾、古坝之间是也。”据考，不确
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元封五年 | 前106年 | 置州。南海郡属交趾州。交州治广信（今封开）
| 交（趾）州南海郡番禺县
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建安六年 | 201年 | | | 析番禺、博罗地置增城县
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建安二十二年 | 217年 | 吴交州刺史重建番禺城。交州治所从广信移番禺
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三国吴 | 黄武五年 | 226年 | 划合浦以北为广州，辖南海等四郡。广州州治及南海郡治均设番禺
| 广告同海郡番禺县
| | “广州”之名自此始
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东晋 | 咸和六年 | 331年 | | | 析番禺、博罗地置东官（东莞）郡
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东晋 | 隆安四年 | 400年 | | | 析出怀化县
| 怀化，略同今之从化，宋齐有县，梁陈无考
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隋 | 开皇九年 | 589年 | 置广州总管府，废郡
| 广州总管府番禺县
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开皇十年 | 590年 | 撤番禺县改为南海县
| 广州总管府南海县
| | 南海建县，一说在南朝梁天监六年（507年）
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仁寿元年 | 601年 | 改广州为番州
| 番州南海县
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大业三年 | 607年 | 罢州复置郡
| 南海郡南海县
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唐 | 武德四年 | 621年 | 复置广州总管府、复置番禺县、移治江南洲
| 广州总管府广州番禺县
| | 一说于长安三年（703年）才复置番禺县。江南洲在今广州河南
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武德七年 | 624年 | 置广州都督府
| 广州都督储广州番禺县
| | 岭南45州分属广州、桂州（桂林）、容州（北流）、邕州（南宁）、安南（今越南河内）５个都督府。五府皆隶广州
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贞观元年 | 627年 | 置岭南道
| 岭南道广州都督府广州番禺县
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长安三年 | 703年 | 置岭南五府经略使，由广州刺史兼，总管岭南五府
| 岭南道南海郡番禺县
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至德元年 | 756年 | 改经略使为节度使
| 岭南道广州番禺县
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咸通三年 | 862年 | 岭南分东、西二道
| 岭南东道广州番禺县
| | 岭南分东、西北此始
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乾宁二年 | 895年 | 改岭南东道为清海军
| 清海军广州郡番禺县
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五代南汉 | 乾亨元年 | 917年 | 改广州为兴王府
| 兴王府番禺县
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宋 | 开宝四年 | 971年 | 宋平南汉，改兴王府为广南东区
| 广南东区广州（都督）府番禺县
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开宝五年 | 972年 | 再废番禺并入南海县
| 广南东区广州府南海县
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至道三年 | 997年 | 改置广南东路
| 广南东路广州府南海县
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皇三年 | 1051年 | 复析南海县地置番禺县，县治在城东紫泥港（巷）
| 广南东路广州府番禺县
| | 广州东城为番禺地，西城为南海地
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祥兴元年 | 1278年 | 改广州府为翔龙府
| 广南东路翔龙府番禺县
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元 | 至元十七年 | 1280年 | 元军占广州后改称广东道。县治在东城内
| 江西行省广东道广州路番禺县
| | 至元三十年（1293年）曾改为“广东道上路”，九年后恢复原称
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明 | 洪武二年 | 1369年 | 置广东行省
| 广东行省广州府番禺县
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洪武九年 | 1376年 | 置广东布政司
| 广东布政司广州府番禺县
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弘治二年 | 1489年 | | 广东布政司广州府番禺县
| 析番禺、增城地置从化县
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清 | 顺治四年 | 1647年 | 清军占广州后设两广总督。地方政区分省、道、府、县四级
| （两广总督）广东省广肇罗道广州府番禺县
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康熙二十五年 | 1686年 | | （两广总督）广东省广肇罗道广州府番禺县
| 从番禺、南海等县析地置花县
| 析出番禺狮岭司五堡
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民国 | 元年 | 1912年 | 裁府。全省划为六道。粤海道辖广州府、肇庆府罗定州属三十县。省、道治均设番禺
| 广东省粤海道番禺县
| | 粤海道又名广肇罗道。1920年撤道
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7年 | 1918年 | 广州设市政公所
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10年 | 1921年 | 广州正式建市
| | 县辖的捕属（广州东片）及河南市区划入广州市
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14年 | 1925年 | 7月，在广州成立中华民国国民政府。广东省政府改组。全省划为6个行政区。番禺属广州行政区
| 广东省广州行政区番禺县
| | 6个政区为：广州、北江、东江、西江、南路、海南
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21年 | 1932年 | 12月，县治从广州迁至新造
| | | 原县署在德政北路口
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25年 | 1936年 | 广东设9个行政督察区，番禺属第一区
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26年 | 1937年 | | 7月，县属公和乡、敦和乡、沥乡、彬社乡（今海珠新）、崇文二十四乡（今芳村区）、龙洞堡、石牌堡、冼猎扬、车陂堡（今天河黄埔区）划属广州
| 抗日战争期间，为动员民众抗日，左列各乡于1938年10月暂归番禺管辖。胜利后，1946年12月，复归广州市
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27年 | 1938年 | 11月，广州、番禺先后沦陷。县政府流徙于钟村、灵山、北兴及沙坪、三水一带
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28年 | 1939年 | 广东省政府迁韶关。全省划为9个行政督察区。番禺属第一区
| 广东省第一行政区番禺县
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29年 | 1940年 | 汪伪县政府成立。伪署一度设南村，后移至广州东山
| 广东省番禺县
| | 汪伪县政府接管原划归市属各乡，并一度代管花县
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民国 | 34年 | 1945年 | 8月，抗战胜利。9月，县署移至市桥
| 广东省第一行政区番禺县
| | 县署初设先锋巷祠堂，1949年初移至市桥海傍路
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中华 人民共和国 | | 1949年 | 10月23日，番禺解放。成立军事管制委员会于市桥
| 广东省珠江三角洲军事管制委员会番禺县
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| 1950年 | 置珠江行政公署，治中山县石岐。4月，成立番禺县人民政府，治市桥
| 广东省珠江行政公署番禺县
| 禺北的北兴乡划归花县。南海县的上恩洲乡划入番禺。禺东十五屯级划东莞县。禺南九如乡沙亭、南涌、乌洲划归顺德县。禺北嘉禾乡的江夏、陈田和佛岭乡的萧岗、黄田及新市划归广州市
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| 1953年 | 改隶粤中行政公署（治江门）
| 广东省粤中行政公署番禺县
| 禺东的茅岗、员村、新塘、观音约、珠村、石宦龙、车陂、棠下、长、沙浦、双岗、文冲、横沙、逻岗、东圃、鱼珠等村及禺南彬社乡的长洲岛划归广州
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| 1956年 | 改隶佛山地区
| 广东省佛山地区番禺县
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| 1958年 | 9月，成立番禺人民公社。一县即为一社。12月，番禺、顺德合并为番顺县，县治设大良镇
| 广东省佛山地区番禺人民公社。合县后为：广东省佛山地区番顺县番禺人民公社
| 1月，禺北禺东的南岗、萝岗、黄陂、石井、江村、嘉禾、神山、岗楼、鸦湖、蚌湖、同文、太和、龙归、良田、竹料、钟落潭、九佛等17乡划归广州
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| 1959年 | 6月，复置番禺顺德二县。番禺沿治市桥。撤销番禺禺人民公社
| 一度改隶广州，不久，仍隶佛山地区
| 7月，中山县属的大岗、黄阁、南沙、万顷沙、珠江农场划归番禺
| 万顷沙、南沙在建国前属东莞
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| 1975年 | 1月，改隶广州市
| 广东省广州市番禺县
| 县属新造公社的深井大队划归广州市黄埔区
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| 1992年 | 5月，撤销番禺县，设立番禺市，由省直辖。省委托广州市代管
| 广东省番禺市
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